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　2.1 運動方程式とポテンシャル

　2.2 ポテンシャルの例

2.2.1 Lennard-Jonesポテンシャル

2.2.2 水のポテンシャル

2.2.3 共有結合系(C, Si)のポテンシャル

　2.3 運動方程式の積分

　2.4 境界条件（時空間スケールの問題）

　2.5 初期条件と温度・圧力制御

　2.6 統計力学的諸量の計算法

　2.7 モンテカルロ法

2. 分子動力学法の基礎