(updated 2002/5/15)
基本的なデータは，ヘッダーと各時間シーンの各原子のx,
y, z座標の羅列よりなる．時間間隔や表示領域などを
ヘッダー部分に指定する．pvutilでは，様々なヘッダーの書き方に対応しており，ヘッダー書式をiniファイルとして
保存できるが，基本形は下記の通り．
[デフォルトのiniファイルを用いて, change header typeで設定をしない場合はこの形式となる］
１行目（整数ｘ３）： 分子タイプ 分子数 シーン数
２行目（実数ｘ３）： 表示領域のx方法寸法，y方向の寸法，z方向の寸法
３行目（実数ｘ２）： １シーン目の時間，シーンごとの時間ステップ
分子タイプは通常１とする．
例えば，c言語では下記のような表現となる．
fprintf(fpos,"1 %d %d\n", nmol,nrep/nwrite);
fprintf(fpos,"%lf %lf %lf\n", vlx*1.0e10,vly*1.0e10,vlz*1.0e10);
fprintf(fpos,"%lf %lf\n", stime,
dt*1.0e12*nwrite);
nmol: 分子数，nrep: 計算の繰り返し数，nwrite:
シーンデータの出力間隔
vlx, vly, vlz: 計算領域の寸法（単位m)：データの座標が(0-vlx),
(0-vly), (0-vlz)の範囲
stime: １シーン目の時間（通常は0), dt: 計算のタイムステップ
メインのデータは，シーン１から順に各分子のx,
y, z座標を書き出す．
１行目（実数ｘ３）：シーン１，１番目の原子のx,
y, z座標
２行目（実数ｘ３）：シーン１，２番目の原子のx,
y, z座標
３行目（実数ｘ３）：シーン１，３番目の原子のx,
y, z座標
．．．．
nmol行目（実数ｘ３）：シーン１，nmol番目の原子のx,
y, z座標
nmol+1行目（実数ｘ３）：シーン２，１番目の原子のx,
y, z座標
nmol+2行目（実数ｘ３）：シーン２，２番目の原子のx,
y, z座標
nmol+3行目（実数ｘ３）：シーン２，３番目の原子のx,
y, z座標
．．．．
．．．．
nmol*nscene行目（実数ｘ３）：シーンnscene，nmol番目の原子のx,
y, z座標
例えば，c言語では，
for(irep=1; irep<=nrep; irep++){
stime=stime+dt;
Step();
if (irep % nwrite == 0){
for(i=1; i<=nmol; i++){
fprintf(fpos, "%lf %lf
%lf\n",
x[i]*1.0e10,y[i]*1.0e10,z[i]*1.0e10);
}
}
}
Change header type ボタンで様々なデータ形式に変更できる．また，そのときのヘッダー形式を
iniファイルとして保存できる．
iniファイルの例として，下記の３通りが用意されている．
kimutatu.ini: defaultのpvutility.iniとほぼ同じであるが，maskファイルを用いる設定となっている．
例として，kimutatu_pos.dat, mask.datが用意されている．これらをkimutatu.iniをすべてpvutility.exeに
ドラッグ＆ドロップするとkimutatu_pos.pvが生成される．
tinoue.ini: シリコンクラスターの分子動力学計算で用いた例．
RegeonCenter(0,0,0)=true と設定してあり，シミュレーション領域が原点を中心とした座標で
かかれたデータを用いる．座標データのx, y,
zの範囲はそれぞれ(-vlx, vlx), (-vly, vly),
(-vlz, vlz)
さらに，原子間隔が3.2A以下の場合にボンドを描くように設定されている．
例としてtinoue_pos.datとtinoue_pos.pvを参照．
yaya.ini: 炭素クラスターのＭＤで用いた例．
金属と炭素の２種類の原子を含む場合である．
例題のyaya_pos.datとyaya_pos.pvを参照．