ナノチューブ座標生成プログラム＋可視化プログラム
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Updated: '02/12/5
(n,m)でカイラリティを指定して，ナノチューブのデカルト座標を生成するWindows用の
プログラムです．
チューブ長さとしては，ユニットセルか自由な長さが設定可能．
生成した座標の可視化用のプログラムもついています．
ついでに，座標作成過程でのグラファイトシートを巻いていくアニメーションも作れます．
下記のファイルをダウンロードしてください：
wrapping.zip (568 KB)
 |
(10,5) Nanotube:
tube length is 2xunitcell,
[nseps]=10 |
簡単な利用法：
- wrapping.zipをダウンロードしたら適当なフォルダに解凍してください．
インストールなどはなしでそのまま使えます．
- wrapping.exeを実行して，カイラル指数(chiral
index n, m)，ボンド長(bond length a)
，チューブ長(tube length)と描画の時の境界の長さ（boundary
length)を指定します．
unitcellボタンを押すと，チューブ長と境界の長さを(n,m)に応じたunitcell分に設定します．
- Wrapping のその他のパラメータ
- 初期配置個数(initial matrix preparation)は最初に並べるポイント数で，大きめな値にしていただければ問題ありません．
(n, m)が大きな場合などで，できたナノチューブが欠けていたりしたら，大きな値にしてください．
- Magの大きさで，画面の倍率が変化します（計算操作説明用ですので出力結果には影響しません）．
- Periodic and only final shapeのチェックを外すと巻いていく途中のデータも出力されます．
これを使うと巻いていくアニメーションができます．
- nstepsは，巻いていくデータのステップ数です．
- make pos.dat のボタンを押しますと，
swnt_pos.datというファイル名でアスキーデータを作ります．
// なお，swnt_pos.datのファイルは，最初の７行のヘッダーを無視しますと
// 単純なx, y, zの座標です．
- その後， Make pv fileを押しますと．コマンドラインで，
＞hpvc.exe swnt_pos.dat swnt_pos.pv
を実行し，アスキーデータから可視化プログラム用のバイナリーデータを作ります．
- さらに，pvwinのボタンを押しますと，
pvwin.exe swnt_pos.pv
が実行され，pvwinで可視化ができます．
windows上でswnt_pos.pvのデータをpvwin.exeにドラッグ・ドロップして
頂いても同じです．
- あとは，pvwin.exeによって，拡大・縮小，回転，アニメーション，Bitmap出力，
windows metafile 出力などができます．
ここにあるpvwin.exeは，分子動力学法シミュレーションの可視化用プログラムの
サブセットです．
詳細は，可視化プログラムのホームページをご覧ください．
このプログラムはかなり汎用的なもので，我々のアニメーション集のデータもすべてこのプログラムで
作成しています．
---以下はpvwinの極めて簡単な使い方です----
- マウスでドラッグ，あるいは矢印キーで回転します．
- Shift - a で alpha, beta の角度を入力するとその角度に回転します．
- ctrl とマウスのホイール あるいは，+, -キーで拡大縮小します．
- f キーで フレームの表示のon/offを切り替えます．
- マウスのダブルクリックあるいは，aキーでアニメーションがスタートします．
- spaceとBackSpaceキーでそれぞれ順方向，逆方向にアニメーションのコマ送りです．
- g キーを押して，フレーム数を入力するとそのフレームになります．
- その他，viewメニューの下のサブメニューで分子を大きくしたり，ボンドを太くしたり，
消したり．．．いろいろできます．
- Ctrl-Cで現在のビューのbitmapをclipboardにコピーします．
- Ctrl-Mですと現在のビューをWindows Meta Fileとしてclipboardにコピーします．
- FileメニューのSave animationとすると，中止するまで，指定したフォルダに画面
で変化したbitmapを連続的に保存します．これを使ってgif
animationなどが簡単にできます．
- その他，メニューに従っていろいろとお試しください．
Frequently Asked Questions and Answers